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[数据分析基础] [视频更新]静息态fMRI数据处理视频教程--SPM、REST、DPARSF操作 ? [复制链接]

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发表于 2009-7-16 18:09:26 |只看该作者 |倒序浏览
静息态功能磁共振数据处理视频教程中文版(第一部分,第二部分)现已发布,大家可到http://www.restfmri.net/forum/Course下载。


静息态功能磁共振数据处理视频教程适用于REST,SPM和DPARSF的新使用者,也有助于理解一些静息态fMRI的基本概念。

静息态功能磁共振数据处理视频教程的主要内容(第一部分,中文版) (对应的PowerPoint pps 文件) Release 091222
1. 使用REST?DICOM Sorter整理原始数据。
2. 使用SPM对数据进行预处理。
3. 使用REST对数据进行去线性趋势、滤波等操作,以及使用REST进行Functional Connectivity (FC),Regional Homogeneity (ReHo),Amplitude of Low-Frequency Fluctuation (ALFF)和Fractional ALFF (fALFF)计算。
4. 使用DPARSF进行批处理分析(从DICOM数据到预处理,再到FC,ReHo,ALFF,fALFF结果)。
5. 使用REST和DPARSF去除协变量,提取感兴趣区(ROI)或AAL脑区的时间序列。

强烈建议新使用者下载本视频教程,可以帮助避免很多数据处理过程中的不必要错误。

下载:视频教程:第一部分,中文版 ? PowerPoint pps

静息态功能磁共振数据处理视频教程的主要内容(第二部分,中文版) (对应的PowerPoint pps 文件) Release 091222
1. 使用SPM进行统计分析。
2. 使用REST Slice Viewer查看结果,设定cluster size,制作ROI mask,保存图片用于发表。
3. 多重比较校正:Monte Carlo模拟与Bonferroni、FDR、FWE校正的区别,以及REST AlphaSim的使用。
4. REST Image Calculator的使用。
5. 其他功能:.nii数据的转换,REST读写接口的使用。

下载:视频教程:第二部分,中文版 ? PowerPoint pps




部分概念可能在旧版教程(080619版)中讲解得详细些,如果有兴趣,亦可下载:视频教程080619版? PowerPoint pps



The Multimedia Course: Data Processing of Resting-State fMRI is for the new users of REST, SPM and DPARSF, and even new researchers of the Resting-State fMRI field.

Main content of the Multimedia Course (Part 1, English version) (Corresponding PowerPoint pps file) Release 091227:
1. How to use REST?DICOM Sorter to arrange your data.
2. How to use SPM to preprocess your data.
3. How to use REST to detrend and filter your data, and how to use REST to calculate FunctionalConnectivity (FC), Regional Homogeneity (ReHo), Amplitude ofLow-Frequency Fluctuation (ALFF), Fractional ALFF (fALFF).
4. How to use DPARSF to perform the one-stop analysis (from DCM2nii, preprocessing to FC, ReHo, ALFF, fALFF calculation).
5. How to use REST and DPARSF to regress out the nuisance covariates and extract ROI or AAL time courses.

I strongly recommend the new users download this multimedia course, this will keep you out of many unnecessary errors.

DOWNLOAD: Multimedia Course: Part 1, English version??? PowerPoint pps

Main content of the Multimedia Course (Part 2, English version) (Corresponding PowerPoint pps file) Release 091227:
1. How to use SPM to perform Statistical Analysis.
2. How to use REST Slice Viewer to view your results, set cluster size,make ROI mask files and create pictures suitable for publication.
3. How to use REST AlphaSim to perform multiple comparison correction.
4. How to use REST Image Calculator.
5. Other functions of REST: converting .nii files to .imd/.hdr files and REST's reading and writing functions.

DOWNLOAD: Multimedia Course: Part 2, English version??? PowerPoint pps
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发表于 2009-7-17 08:29:56 |只看该作者
好东西啊

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发表于 2009-7-28 19:26:11 |只看该作者
i have to say that it's really a great work, in every detail!
deserve try :)


gaolion 于 2009-07-28 21:24 又连续补充说
Re:静息态fMRI数据处理教程--SPM预处理、REST操作,DPARSF批处 ..
NEED MATLAB 7.3 AND UP? ?!

NOT SURE WHETHER IT IS COMPATIBLE WITH SPM8????

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发表于 2009-7-29 17:50:54 |只看该作者
引用第2楼gaolion于2009-07-28 19:26发表的??:
i have to say that it's really a great work, in every detail!
deserve try :)

gaolion 于 2009-07-28 21:24 又连续补充说Re:静息态fMRI数据处理教程--SPM预处理、REST操作,DPARSF批处 ..
NEED MATLAB 7.3 AND UP?? !
.......

MATLAB 7.1 is also OK.
SPM8 compatible. The results are all the same.

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发表于 2009-8-10 11:06:30 |只看该作者

Re:静息态fMRI数据处理教程--SPM预处理、REST操作,DPARSF批处 ..

thank you for your great work!??what version of??spm and matlab??it need?

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发表于 2009-9-12 10:53:31 |只看该作者
MatLab 7.0 or above
SPM5 or SPM8

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发表于 2009-10-12 20:27:52 |只看该作者

Re:静息态fMRI数据处理教程--SPM预处理、REST操作,DPARSF批处 ..

正在学着用

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发表于 2009-10-12 23:39:53 |只看该作者

Re:静息态fMRI数据处理教程--SPM预处理、REST操作,DPARSF批处 ..

你是我的偶像

新滴友

怎么在数据预处理后进行激活分析

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发表于 2009-12-3 15:07:53 |只看该作者

Re:静息态fMRI数据处理教程--SPM预处理、REST操作,DPARSF批处 ..

可以下载,知识猛补啊

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发表于 2009-12-29 15:08:09 |只看该作者

Re:[091229更新]静息态fMRI数据处理视频教程--SPM、REST、DPARSF ..

静息态功能磁共振数据处理视频教程中文版(第一部分,第二部分)现已发布,大家可到http://www.restfmri.net/forum/Course下载。
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